A força magnética é medida em gauss (G) ou Tesla (T) e a frequência em Hertz (Hz). Em relação à frequência o intervalo é muito variável, há estudos que defendem que o uso entre 1 e 5 Hz será benéfico na redução de inflamações, doenças degenerativas, dor generalizada e de 5-20 Hz, irá auxiliar na melhora da circulação sanguínea e na tonificação muscular.

Frequências baixas irão estimular o metabolismo celular incrementando a síntese de ATP, acelerando a síntese de DNA e estimulando a produção de prostaglandinas, que irá gerar um efeito anti-inflamatório e recuperação tecidual frente a lesões existentes. Nos tecidos ósseos, o efeito piezelétrico atrai células de formação óssea como os osteoblastos, devido à formação de dipolos elétricos, este processo irá auxiliar na deposição de minerais, como o cálcio, na região afetada, favorecendo o reparo de fraturas e auxiliando na consolidação. A corrente eletromagnética também terá um efeito estabilizador do armazenamento do cálcio intracelular.

A magnetoterapia irá ter um papel importante em processos álgicos, através da liberação de opioides endógenos do grupo das beta-endorfinas. Na dor neuropática, a analgesia pode ser explicada pela ação dos campos magnéticos nos níveis de fatores de crescimento, promovendo a regeneração nervosa pós lesão e inibindo a atividade de neurotransmissores excitatórios.